Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samsn1P57725 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms