Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms