Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CdaP56389 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CdaP56389 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CdaP56389 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CdaP56389 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CdaP56389 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CdaP56389 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdaP56389 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdaP56389 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdaP56389 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdaP56389 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdaP56389 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdaP56389 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdaP56389 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CdaP56389 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdaP56389 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CdaP56389 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdaP56389 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdaP56389 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdaP56389 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdaP56389 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdaP56389 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdaP56389 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdaP56389 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdaP56389 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdaP56389 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdaP56389 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CdaP56389 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdaP56389 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdaP56389 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdaP56389 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdaP56389 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdaP56389 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdaP56389 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdaP56389 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdaP56389 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdaP56389 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdaP56389 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdaP56389 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdaP56389 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdaP56389 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdaP56389 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdaP56389 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CdaP56389 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdaP56389 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdaP56389 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdaP56389 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdaP56389 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdaP56389 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdaP56389 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdaP56389 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdaP56389 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdaP56389 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdaP56389 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdaP56389 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdaP56389 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdaP56389 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdaP56389 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdaP56389 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdaP56389 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdaP56389 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdaP56389 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CdaP56389 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdaP56389 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdaP56389 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdaP56389 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdaP56389 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdaP56389 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CdaP56389 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CdaP56389 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdaP56389 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdaP56389 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdaP56389 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdaP56389 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdaP56389 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdaP56389 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdaP56389 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdaP56389 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdaP56389 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms