Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab8aP55258 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab8aP55258 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab8aP55258 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab8aP55258 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab8aP55258 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab8aP55258 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab8aP55258 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab8aP55258 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab8aP55258 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab8aP55258 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab8aP55258 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab8aP55258 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab8aP55258 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab8aP55258 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab8aP55258 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab8aP55258 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab8aP55258 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab8aP55258 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab8aP55258 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms