Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna1P52793 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna1P52793 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna1P52793 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna1P52793 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna1P52793 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna1P52793 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna1P52793 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms