Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpc4P51655 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpc4P51655 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpc4P51655 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpc4P51655 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpc4P51655 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc4P51655 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms