Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnnt2P50752 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt2P50752 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.4 ms