Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psen1P49769 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psen1P49769 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psen1P49769 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psen1P49769 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psen1P49769 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psen1P49769 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psen1P49769 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psen1P49769 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms