Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms