Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax9P47242 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax9P47242 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax9P47242 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax9P47242 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms