Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox7P40646 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox7P40646 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox7P40646 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox7P40646 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox7P40646 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox7P40646 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox7P40646 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms