Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TpoP35419 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TpoP35419 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TpoP35419 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TpoP35419 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TpoP35419 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TpoP35419 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TpoP35419 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TpoP35419 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TpoP35419 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TpoP35419 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TpoP35419 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TpoP35419 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TpoP35419 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TpoP35419 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TpoP35419 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TpoP35419 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TpoP35419 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TpoP35419 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TpoP35419 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TpoP35419 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TpoP35419 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TpoP35419 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TpoP35419 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TpoP35419 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TpoP35419 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TpoP35419 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TpoP35419 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TpoP35419 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TpoP35419 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TpoP35419 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TpoP35419 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TpoP35419 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TpoP35419 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TpoP35419 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TpoP35419 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TpoP35419 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TpoP35419 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TpoP35419 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TpoP35419 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TpoP35419 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TpoP35419 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TpoP35419 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TpoP35419 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TpoP35419 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TpoP35419 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TpoP35419 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TpoP35419 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TpoP35419 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TpoP35419 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TpoP35419 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TpoP35419 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TpoP35419 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TpoP35419 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TpoP35419 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TpoP35419 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TpoP35419 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TpoP35419 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TpoP35419 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TpoP35419 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TpoP35419 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TpoP35419 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TpoP35419 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TpoP35419 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TpoP35419 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TpoP35419 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TpoP35419 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TpoP35419 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TpoP35419 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TpoP35419 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TpoP35419 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TpoP35419 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TpoP35419 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TpoP35419 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TpoP35419 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TpoP35419 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TpoP35419 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TpoP35419 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TpoP35419 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TpoP35419 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TpoP35419 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TpoP35419 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TpoP35419 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TpoP35419 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TpoP35419 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TpoP35419 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TpoP35419 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TpoP35419 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TpoP35419 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TpoP35419 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TpoP35419 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TpoP35419 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TpoP35419 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TpoP35419 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TpoP35419 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TpoP35419 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TpoP35419 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TpoP35419 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms