Protein–RNA interactions for Protein: P35293

Rab18, Ras-related protein Rab-18, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab18P35293 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab18P35293 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab18P35293 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Rab18P35293 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab18P35293 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab18P35293 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rab18P35293 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rab18P35293 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rab18P35293 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rab18P35293 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab18P35293 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rab18P35293 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rab18P35293 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab18P35293 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab18P35293 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab18P35293 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab18P35293 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rab18P35293 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms