Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mmp12P34960 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmp12P34960 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms