Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms