Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgaP26339 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgaP26339 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgaP26339 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms