Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms