Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NdnP25233 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NdnP25233 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NdnP25233 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NdnP25233 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NdnP25233 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NdnP25233 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NdnP25233 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NdnP25233 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NdnP25233 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NdnP25233 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NdnP25233 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NdnP25233 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NdnP25233 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NdnP25233 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NdnP25233 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NdnP25233 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NdnP25233 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NdnP25233 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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NdnP25233 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NdnP25233 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NdnP25233 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NdnP25233 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NdnP25233 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NdnP25233 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NdnP25233 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NdnP25233 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NdnP25233 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NdnP25233 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NdnP25233 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NdnP25233 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NdnP25233 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NdnP25233 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NdnP25233 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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