Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk11bP24788 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk11bP24788 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms