Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PparaP23204 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PparaP23204 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PparaP23204 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PparaP23204 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PparaP23204 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PparaP23204 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PparaP23204 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PparaP23204 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PparaP23204 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PparaP23204 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PparaP23204 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PparaP23204 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PparaP23204 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PparaP23204 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PparaP23204 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PparaP23204 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PparaP23204 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PparaP23204 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PparaP23204 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PparaP23204 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PparaP23204 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PparaP23204 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PparaP23204 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PparaP23204 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PparaP23204 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PparaP23204 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PparaP23204 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PparaP23204 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PparaP23204 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PparaP23204 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PparaP23204 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PparaP23204 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PparaP23204 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PparaP23204 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PparaP23204 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PparaP23204 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PparaP23204 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PparaP23204 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PparaP23204 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PparaP23204 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PparaP23204 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PparaP23204 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PparaP23204 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PparaP23204 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PparaP23204 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PparaP23204 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PparaP23204 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PparaP23204 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PparaP23204 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PparaP23204 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PparaP23204 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PparaP23204 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PparaP23204 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PparaP23204 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PparaP23204 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PparaP23204 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PparaP23204 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PparaP23204 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PparaP23204 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PparaP23204 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PparaP23204 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PparaP23204 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PparaP23204 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PparaP23204 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PparaP23204 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PparaP23204 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PparaP23204 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PparaP23204 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PparaP23204 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PparaP23204 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PparaP23204 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PparaP23204 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms