Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcer1aP20489 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms