Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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