Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms