Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou4f1P17208 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pou4f1P17208 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou4f1P17208 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou4f1P17208 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou4f1P17208 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou4f1P17208 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou4f1P17208 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou4f1P17208 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou4f1P17208 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou4f1P17208 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou4f1P17208 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou4f1P17208 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou4f1P17208 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou4f1P17208 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms