Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rag1P15919 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rag1P15919 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rag1P15919 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rag1P15919 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rag1P15919 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rag1P15919 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms