Protein–RNA interactions for Protein: P12849

Prkar1b, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1bP12849 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkar1bP12849 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkar1bP12849 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkar1bP12849 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkar1bP12849 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkar1bP12849 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms