Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nr4a1P12813 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms