Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fv4P11370 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fv4P11370 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fv4P11370 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fv4P11370 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fv4P11370 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fv4P11370 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fv4P11370 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms