Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbbP0CG49 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms