Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxa9P09631 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms