Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SparcP07214 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SparcP07214 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SparcP07214 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SparcP07214 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SparcP07214 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SparcP07214 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SparcP07214 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SparcP07214 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SparcP07214 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SparcP07214 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SparcP07214 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SparcP07214 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SparcP07214 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SparcP07214 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SparcP07214 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SparcP07214 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SparcP07214 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SparcP07214 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SparcP07214 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SparcP07214 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SparcP07214 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SparcP07214 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SparcP07214 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SparcP07214 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SparcP07214 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SparcP07214 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SparcP07214 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SparcP07214 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SparcP07214 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SparcP07214 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SparcP07214 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SparcP07214 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SparcP07214 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SparcP07214 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SparcP07214 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SparcP07214 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SparcP07214 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SparcP07214 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SparcP07214 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SparcP07214 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SparcP07214 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SparcP07214 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SparcP07214 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SparcP07214 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SparcP07214 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SparcP07214 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SparcP07214 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SparcP07214 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SparcP07214 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SparcP07214 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SparcP07214 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SparcP07214 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SparcP07214 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SparcP07214 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SparcP07214 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SparcP07214 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SparcP07214 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SparcP07214 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SparcP07214 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SparcP07214 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SparcP07214 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SparcP07214 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SparcP07214 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SparcP07214 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SparcP07214 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SparcP07214 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SparcP07214 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SparcP07214 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SparcP07214 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SparcP07214 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SparcP07214 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SparcP07214 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms