Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lancl1O89112 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms