Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vti1bO88384 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms