Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn20O55082 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn20O55082 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms