Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FxnO35943 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FxnO35943 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FxnO35943 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FxnO35943 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FxnO35943 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FxnO35943 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FxnO35943 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FxnO35943 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FxnO35943 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FxnO35943 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FxnO35943 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FxnO35943 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FxnO35943 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FxnO35943 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FxnO35943 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FxnO35943 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FxnO35943 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FxnO35943 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FxnO35943 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FxnO35943 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FxnO35943 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FxnO35943 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FxnO35943 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FxnO35943 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FxnO35943 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FxnO35943 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FxnO35943 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FxnO35943 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FxnO35943 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FxnO35943 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FxnO35943 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FxnO35943 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FxnO35943 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FxnO35943 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FxnO35943 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms