Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1baO35930 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1baO35930 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms