Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Sp100O35892 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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Sp100O35892 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Sp100O35892 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Sp100O35892 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Sp100O35892 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Sp100O35892 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Sp100O35892 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Sp100O35892 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Sp100O35892 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp100O35892 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Sp100O35892 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Sp100O35892 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Sp100O35892 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp100O35892 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp100O35892 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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