Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd2O35392 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd2O35392 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms