Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CenpaO35216 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CenpaO35216 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CenpaO35216 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpaO35216 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpaO35216 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms