Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf6O08584 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf6O08584 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf6O08584 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf6O08584 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf6O08584 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf6O08584 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klf6O08584 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf6O08584 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms