Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm42783-201ENSMUST00000197075 795 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms