Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5849J3QPE5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms