Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Smim18J3QNP2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Smim18J3QNP2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Smim18J3QNP2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Smim18J3QNP2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Smim18J3QNP2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim18J3QNP2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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