Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms