Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms