Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pot1bH7BX60 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pot1bH7BX60 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms