Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip12G5E870 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms