Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim15G3UY57 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.4 ms