Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8005F6YKY3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8005F6YKY3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8005F6YKY3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8005F6YKY3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8005F6YKY3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8005F6YKY3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8005F6YKY3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8005F6YKY3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8005F6YKY3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8005F6YKY3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8005F6YKY3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8005F6YKY3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8005F6YKY3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8005F6YKY3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8005F6YKY3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8005F6YKY3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8005F6YKY3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms