Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga10E9Q6R1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga10E9Q6R1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms